אפשר אולי להציע ביאור "מקומו" ע"פ הפסוק:
כי הנה ה' יצא ממקומו, וירד ודרך על במותי ארץ : (מיכה א-ג)
וכותב רש"י - ממקומו. מכסא רחמים לכסא הדין.
וא"כ יתכן שמה שאומרים בקדושה הנ"ל, וכן "ממקומך מלכינו תופיע", הכוונה על דרך הסבר רש"י שם ש"מקומך" היינו כסא רחמים.